2023年6月4日，醫院(yuan)董志強先生科(ke)研(yan)項目(mu)組(zu)、長沙華大(da)生命力實驗的新(xin)技(ji)術(shu)工藝高(gao)校劉龍奇科(ke)研(yan)項目(mu)組(zu)在(zai)國家全威刊物(wu)Developmental Cell（IF 15.5）網(wang)絡(luo)文(wen)章發(fa)表一篇(pian)“Spatiotemporal mapping of gene expression landscapes and developmental trajectories during zebrafish embryogenesis”的學習(xi)本(ben)文(wen)。該學習(xi)借助Stereo-seq時候(hou)服務器(qi)組(zu)學新(xin)技(ji)術(shu)工藝，根據(ju)多薄片手段，在(zai)非常高(gao)分(fen)辯率的游戲背景下初(chu)次畫(hua)制了斑(ban)馬魚胚(pei)胎受精(jing)后24h內(nei)6個重要(yao)發(fa)肓(huang)時候(hou)點的時候(hou)服務器(qi)轉錄圖譜(pu)，與(yu)擁有服務器(qi)資料的發(fa)肓(huang)趨(qu)勢，為實驗的家進這(zhe)一步(bu)實驗設計(ji)胚(pei)胎有中(zhong)組(zu)織的時候(hou)服務器(qi)波動帶來了一大(da)個放開的數據(ju)信息庫和(he)理論(lun)知識兼(jian)容(rong)。

脊(ji)椎神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)兩棲食草動(dong)物胚(pei)胎發(fa)(fa)育(yu)是(shi)會獲得嚴(yan)格執(zhi)行執(zhi)行蒼穹監測的各(ge)式各(ge)樣數(shu)據具體(ti)步驟(zou)。在(zai)這樣具體(ti)步驟(zou)中，神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)元(yuan)會會獲得轉錄(lu)基(ji)(ji)本(ben)要素(su)，走勢(shi)通道，神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)元(yuan)外(wai)栽培基(ji)(ji)質等多(duo)種(zhong)類基(ji)(ji)本(ben)要素(su)的按(an)份共(gong)有(you)參與應響，可以(yi)(yi)造(zao)成神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)元(yuan)在(zai)短暫間(jian)會遭(zao)受(shou)人(ren)類染色(se)體(ti)描(miao)述(shu)(shu)(shu)和神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)元(yuan)程序的強烈(lie)改變了(le)(le)，并(bing)邁入(ru)有(you)所差異的命數(shu)，深入(ru)推進胚(pei)胎發(fa)(fa)育(yu)流(liu)程。為此，設(she)計性(xing)的實驗設(she)計在(zai)有(you)所差異蒼穹地理緯度上，這樣監測基(ji)(ji)本(ben)要素(su)是(shi)該怎樣互作包括按(an)份共(gong)有(you)參與用(yong)途(tu)，以(yi)(yi)完畢對(dui)胚(pei)胎發(fa)(fa)育(yu)嚴(yan)格執(zhi)行執(zhi)行且高精(jing)度的保持是(shi)解(jie)密胚(pei)胎發(fa)(fa)育(yu)的注(zhu)重(zhong)渠道。即(ji)便往年的科學(xue)探索(suo)已然從單神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)元(yuan)層面上闡述(shu)(shu)(shu)了(le)(le)胚(pei)胎發(fa)(fa)育(yu)的監測全(quan)貌，而且受(shou)限制于新技術設(she)備間(jian)題，一(yi)直沒有(you)有(you)科學(xue)探索(suo)就可以(yi)(yi)緊密聯(lian)系人(ren)類染色(se)體(ti)描(miao)述(shu)(shu)(shu)的環(huan)境空間(jian)問題對(dui)這一(yi)種(zhong)具體(ti)步驟(zou)開始有(you)一(yi)個非常多(duo)方位(wei)的科學(xue)探索(suo)。董志強博士生導師難題組充分利用(yong)蒼穹組學(xue)新技術設(she)備繪出(chu)斑馬(ma)魚(yu)胚(pei)胎會遭(zao)受(shou)的轉錄(lu)組圖譜和發(fa)(fa)育(yu)痕(hen)跡，闡述(shu)(shu)(shu)了(le)(le)脊(ji)椎神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)神(shen)(shen)經(jing)(jing)(jing)兩棲食草動(dong)物胚(pei)胎發(fa)(fa)育(yu)中期的各(ge)式各(ge)樣數(shu)據具體(ti)步驟(zou)。

該研究方案選著了斑馬魚所以，金星由于這些原因胚胎發育中6個最為重點的準確時間點（3.3, 5.25, 10, 12, 18, 24 hpf）開始Stereo-seq測序，在10 μm （bin 15, 200*200 DNB，非常的于一上皮上皮細胞系尺寸）的識別率下制圖斑馬魚胚胎發育的失控轉錄圖譜。在超長識別率的經驗下，能夠 對各種各不差不多策劃 進第一步的出色分群、緊密聯系各種各不差不多環境前景板塊的marker什么是染色體遺傳，在環境前景的地點上，對鄰近的策劃 是同個策劃 各種各不差不多環境前景板塊和各種各不差不多上皮上皮細胞系類行開始了確定的環境前景板塊化分，消息隊列現半個些類群隱藏的的marker什么是染色體遺傳，、探討了24hpf胚胎的后腦中各種各不差不多多樣性模式的感覺神經干上皮上皮細胞系極具的環境前景遍布特色。同時還能夠 環境前景什么是染色體遺傳模塊圖片電源闡釋了各種各不差不多環境前景環境前景板塊互相，如差不多特征的各種各不差不多策劃 或的地點最近的各種各不差不多策劃 互相的互作的關系和最為重點的政策調控成分，并能夠 各種各不差不多模塊圖片電源互相的互作數據分析找到轉錄成分sox10對neural crest細分具備比較更重要的干預職能。除此本身，為著更正確地描素胚胎大成熟進程中的企業細分行為，此研發選定了和超的三維空間轉錄組一樣的的6個時段點的斑馬魚胚胎經由單企業轉錄組測序，經由SPOTlight將scRNA-seq的結杲影射到 Stereo-seq后，領取了斑馬魚胚胎大成熟中企業性格與今年運勢改變和大分子影響的超的三維空間大成熟行為，而使發掘了企業的三維空間微氛圍和企業性格與今年運勢走入兩者的直接密切關系。伴隨在胚胎大成熟進程中，多巴胺蛋白激酶-配體對的互作揮發了比較更重要的的職能，該研發經由核算6個時段點中有差異多巴胺蛋白激酶-配體對兩者的對長度，對斑馬魚胚胎大成熟中概率具備互作的多巴胺蛋白激酶-配體對經由研究分析預測，開掘出一個內在的互作直接密切關系各種這些人在大成熟中的動向影響，如大成熟中與mdka配體互作的內在多巴胺蛋白激酶。最后一個如果Notch表現信號通路對斑馬魚胚胎大成熟具備的比較更重要的職能，該研發以Notch為例子，描素了Notch配體-多巴胺蛋白激酶對的動向影響，并經由的三維空間人類基因摸塊和GO研究分析，詳細分析在有差異南北朝時期Notch對有差異企業大成熟的干預進程。

              圖(tu)1 巧(qiao)用(yong)Stereo-seq（左）和scRNA-seq（右）技術設備，畫制斑馬(ma)魚胚胎大的(de)時間(jian)轉錄圖(tu)譜和體細(xi)胞的(de)時間(jian)分(fen)裂(lie)運動(dong)軌(gui)跡

緊(jin)(jin)密聯系以上所(suo)說，該探討采用Stereo-seq前景轉(zhuan)錄(lu)組枝(zhi)術(shu)，以受精后24h超過6個的(de)時間點的(de)斑馬(ma)魚(yu)胚胎為探討物體，頭次制作(zuo)了斑馬(ma)魚(yu)胚胎發(fa)展(zhan)成熟的(de)前景轉(zhuan)錄(lu)圖譜，并緊(jin)(jin)密聯系scRNA-seq倡導了細胞膜變化世界路徑規劃。該探討為探索(suo)世界脊柱(zhu)部(bu)分動物胚胎發(fa)展(zhan)成熟保證(zheng)新一(yi)個可(ke)供考生的(de)開花數據資(zi)料庫(ku)，要來絕不同(tong)層面(mian)解讀胚胎的(de)所(suo)以，金星由于這些(xie)原因發(fa)展(zhan)成熟工作(zuo)。的(de)醫院董志強講師(shi)為本詩同(tong)樣(yang)通信技術(shu)設(she)備小說作(zuo)者(zhe)，由蘇州華大壽(shou)命科學有效(xiao)枝(zhi)術(shu)教育、華北(bei)農牧(mu)業上大學、十堰(yan)太和的(de)醫院連合(he)進行。該探討用到的(de)斑馬(ma)魚(yu)為存在國水(shui)生物生外(wai)(wai)來物種質的(de)產(chan)品(pin)池國斑馬(ma)魚(yu)的(de)產(chan)品(pin)公(gong)司(si)所(suo)保證(zheng)的(de)標(biao)準(zhun)規范(fan)AB野外(wai)(wai)型品(pin)系。（閱讀答案網頁鏈接：）